Die Vaterunserkirche pflegt eine lebendige ökumenische Zusammenarbeit mit den beiden Katholischen Nachbargemeinden
Dazu gehören:
- Ökumische Gottesdienste in der Weihnachtszeit und am Buß- und Bettag mit Predigertausch
- Der Betrieb der Lebensmittelausgabestation Münchner Tafel donnerstags in der Vaterunserkirche
- Ein wöchentlich im Wechsel stattfindender Seniorennachmittag mit abwechslungsreichem Programm (mit St.-Thomas)
- Eine ökumenisch betriebene Bücherei in der Vaterunserkirche mit kostenloser Ausleihe (mit St.-Thomas)
- Entsendung eines Vertreters in die Pfarrgemeinderats- bzw. Kirchenvorstandssitzung